风都塔建成30周年的夏天，X集团派出直升机运送了从“A”到“Z”，共计26个第二代盖亚记忆体——T2盖亚记忆体。但是直升机遭到了佣兵集团“不死者”的猛烈攻击，最终自爆。26个T2盖亚记忆体散落至风都各处，导致市民一个接一个地变成了掺杂体。想要平息这场风波的双骑还有警骑，遇上了国际特务调查机关的玛利亚女士，并从她那里了解了事情的来龙去脉。而菲利普却觉得玛利亚女士可能是他的母亲。这时，得到了T2盖亚记忆体的不死者开始侵略风都，不死者的领导人大道克己变身为假面骑士永骑，拦在了双骑和警骑面前，永恒记忆体让上一代的盖亚记忆体失效了。无法变身的双骑和警骑依然立志守卫风都，他们在被敌方占领的风都塔上与不死者展开了决战，最终打败了永骑，守住了风都的和平。